Métodos eficientes para a detecção de padrões exactos (pattern-matching) em sequências biológicas
Os algoritmos de detecção de padrões (pattern-matching), sejam exactos ou aproximados, são fundamentais na maioria das aplicações orientadas à análise de sequências biológicas. Nesta comunicação apresenta-se um novo algoritmo, denominado DC, desenvolvido para a especificidade do pattern-matching exa...
Main Author: | |
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Format: | conferenceObject |
Language: | por |
Published: |
2011
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Subjects: | |
Online Access: | http://hdl.handle.net/10198/4429 |
Country: | Portugal |
Oai: | oai:bibliotecadigital.ipb.pt:10198/4429 |
Summary: | Os algoritmos de detecção de padrões (pattern-matching), sejam exactos ou aproximados, são fundamentais na maioria das aplicações orientadas à análise de sequências biológicas. Nesta comunicação apresenta-se um novo algoritmo, denominado DC, desenvolvido para a especificidade do pattern-matching exacto, bem como uma análise comparativa do seu desempenho. Conclui-se que o desempenho do novo algoritmo supera, em média, o dos seus concorrentes, atribuindo-se o ganho de eficiência, sobretudo, à introdução de uma nova regra de filtragem denominada regra de compatibilidade. |
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